Cancer: Dessa 4 gener hjälper till att förutsäga resultatet
Omfattande forskning om rollen som tumörundertryckaren p53 ger en större förståelse för de genetiska mutationer som spelas i olika former av cancer, samt identifierar fyra gener som kan hjälpa till att förutsäga en persons syn.
De TP53 genen är ansvarig för kodning av vad forskare kallar tumörprotein p53 - en tumörundertryckare som kan hindra celler från att dela sig och sprida sig för snabbt.
Forskare har dubbat TP53 ”genomets väktare” på grund av dess avgörande roll för att förebygga tumörer och hålla celldelningen i schack.
Mänskliga cancerformer har ofta mutationer i TP53 gen, vilket får en av de kritiska defensiva mekanismerna mot cancer att misslyckas.
De första studierna som identifierades TP53 mutationer i humant cancer uppträdde på 1980-talet och sedan dess har forskare lagt ner mycket tid och resurser på att klargöra dess roll i cancer.
Nu använder den största studien i sitt slag tumörprover från över 10 000 cancerpatienter och undersöker 32 olika typer av cancer för att bättre förstå rollen hos TP53.
Dr. Larry Donehower, professor i molekylär virologi och mikrobiologi vid Baylor College of Medicine i Houston, TX, ledde den nya forskningen, som visas i tidskriften Cellrapporter.
Telltale 4-gener kan hjälpa till att förutsäga utsikterna
Dr. Donehower och team använde fem olika dataplattformar för att extrahera 10 225 prover från 32 cancerformer. Med hjälp av Cancer Genome Atlas (TCGA) kunde forskarna på ett omfattande sätt bedöma rollen för p53-vägen i dessa 32 cancerformer.
Dr. Donehower och kollegor jämförde sedan TCGA-data med en annan databas med 80 000 genetiska mutationer som Dr. Thierry Soussi - en professor i molekylärbiologi vid Sorbonne University i Paris, Frankrike - hade samlat under en period av 30 år.
Forskarna fann det TP53 mutationer inträffade oftare hos människor som hade en sämre syn. Vidare fann analysen att ”Mer än 91% av cancerformerna med TP53 mutationer visar förlust av båda funktionella TP53 alleler, ”eller genvarianter.
Dr. Donehower förklarar: "I vissa cancergener ser du en kopia av de två generna förlorade eller muterade", men "över 91 procent av alla cancerformer förlorar båda TP53 gener, inte bara en. ”
Den andra allelförlusten, skriver författarna, inträffade genom ”mutation, kromosomal radering eller kopieringsneutral förlust av heterozygositet” - det vill säga genduplicering. Den ledande forskaren konstaterar också att den här sista processen inträffade mycket oftare än de tidigare trodde.
Viktigt är att forskningen identifierade också fyra gener som visade överuttryck i mutant TP53 tumörer. Enligt forskarna kan dessa fyra gener "berätta" om en cancerpatient har en god syn eller inte.
”Om du har ett högt uttryck för dessa fyra gener, har du en patient som är mer benägna att ha en dålig prognos [...] Omvänt, om den patienten har ett mycket lågt uttryck för dessa gener, kommer han förmodligen att överleva längre och ha en bra prognos. ”
Dr. Larry Donehower
”Det ger dig en bättre bild av hur han kommer att klara sig än att bara veta om han är mutant för TP53 eller inte, fortsätter Dr. Donehower.
Slutligen studien starkt associerad TP53 mutationer med genomisk instabilitet, ett resultat som är i linje med TP53'S typiska roll som "genomets väktare."
Dr. Donehower kommenterar den unika forskningen och säger: "De flesta studier på TP53 fokusera på en cancertyp. ”
"Om man tittar på 32 olika cancertyper ser man att vissa mönster håller upp oavsett cancertyp."
Studie medförfattare och chef för Cancer Genomics vid Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, kommenterar också betydelsen av resultaten.
Han säger: ”Sedan TP53 är en av de viktigaste portvakterna inom cancerförebyggande, ju bättre vi förstår denna gen, desto bättre kan vi förstå cancerens grundläggande biologi. Det kommer att leda till bättre terapier. ”
